要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOFunction”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见GOFunction.
Bioconductor版本:3.1
GO功能包提供了一种工具,可以解决GO结构或多个注释基因造成的冗余,并根据一些直观的假设和统计测试,从统计显著的功能中推导出生物学相关的功能。
作者:晶王<晶王。Uestc在gmail.com>
维护者:Jing Wang
引文(从R内,输入引用(“GOFunction”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GOFunction”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GOFunction”)
R脚本 | function | |
参考手册 |
biocViews | 去,GeneSetEnrichment,微阵列,通路,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 2.11.0),方法,Biobase(> = 2.8.0),图(> = 1.26.0),Rgraphviz(> = 1.26.0),GO.db(> = 2.4.1)AnnotationDbi(> = 1.10.2),SparseM(> = 0.85) |
进口 | 方法,Biobase,图,Rgraphviz,GO.db,AnnotationDbi,SparseM |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GOFunction_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOFunction_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GOFunction_1.16.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | GOFunction_1.16.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GOFunction/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOFunction/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |