要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GGtools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GGtools

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见GGtools

基因表达遗传学分析软件和数据

Bioconductor版本:3.1

用于基因表达和/或DNA甲基化遗传学分析的软件和数据

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

引文(从R内,输入引用(“GGtools”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GGtools”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GGtools”)

PDF R脚本 GGtools: eQTL鉴定软件
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneticVariability遗传学单核苷酸多态性软件
版本 5.4.0
在Bioconductor BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.14),GGBase(> = 3.19.7),data.table、并行
进口 方法,utils,统计,BiocGenericssnpStatsffRsamtoolsAnnotationDbiBiobaseVariantAnnotationhexbinrtracklayerGvizstats4,S4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRanges迭代器BiostringsROCRbiglmggplot2reshape2
链接
建议 GGdatailluminaHumanv1.dbSNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608大气气溶胶rmeta
SystemRequirements
增强了 MatrixEQTLHomo.sapiensforeachdoParallelgwascat
URL
全靠我 ceu1kgcgdv17cheung2010encoDnaseIggtut
进口我 ceuhm3
建议我 GGBasegQTLBasehmyriB36ind1KG
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GGtools_5.4.0.tar.gz
Windows二进制 GGtools_5.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GGtools_5.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) GGtools_5.4.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GGtools/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
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