- 首页
- Bioconductor 3.1
- 软件包
- 有限元法
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“FEM”)
在大多数情况下，您根本不需要下载包存档。
有限元法
  |
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见有限元法．
功能表观遗传模块的鉴定
Bioconductor版本:3.1
FEM包执行DNA甲基化和基因表达数据的系统级综合分析。它寻找功能相关基因的模块，显示差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的反向关联被假设。详情请见Jiao et al Bioinformatics 2014。
作者:Andrew E. Teschendorff，焦银明
维护者:Andrew E. Teschendorff < Andrew at picb.ac.cn>
引文(从R内，输入引用(“有限元”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“FEM”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“有限元”)
| R脚本 | FEM包执行DNA甲基化和基因表达的系统级综合分析。它寻找功能相关基因的模块，显示差异启动子DNA甲基化和差异表达，其中启动子DNA甲基化和基因表达之间的反向关联被假设。详情请见Jiao et al Bioinformatics 2014。 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression，DifferentialMethylation，NetworkEnrichment，软件，SystemsBiology |
| 版本 | 2.2.1 |
| 在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | AnnotationDbi，矩阵，marray，corrplot，igraph，嫁祸于，limma，org.Hs.eg.db |
| 进口 | 图 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 包的来源 | FEM_2.2.1.tar.gz |
| Windows二进制 | FEM_2.2.1.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | FEM_2.2.1.tgz |
| Mac OS X 10.9 (Mavericks) | FEM_2.2.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/FEM/tree/release-3.1 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FEM/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
