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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ enrichmentbrowser”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅富集兄弟。
生物导体版本:3.1
富集兄弟软件包实现了基因表达数据富集分析的基本功能。该分析结合了基于集合和基于网络的富集分析的优势,以得出高信心基因集和生物学途径,这些基因集和生物学途径在所研究的表达数据中受到差异调节。此外,包装有助于对此类集合和途径的可视化和探索。
作者:路德维希·盖斯林格(Ludwig Geistlinger)
维护者:bio.ifi.lmu.de>的路德维希·盖斯林格<路德维格。
引用(从r内,输入引用(“富集”)
):
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Browsevignettes(“富集”)
R脚本 | 丰富的兄弟手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,rnaseq,,,,报告写作,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.2.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.0.0),生物酶,,,,gseabase,,,,PathView |
进口 | AnnotationDbi,,,,复杂的图像,,,,deseq2,,,,EDASEQ,,,,基因组机,,,,go.db,,,,keggrest,,,,kegggraph,,,,大量的,,,,路径网,,,,报告工具,,,,rgraphviz,,,,S4VECTORS,,,,Sparsem,,,,Spia,,,,生物图,,,,Biomart,,,,EDGER,,,,Geneplotter,,,,图形,,,,HWRITER,,,,林玛,,,,混音工具,,,,Neagui,,,,NPGSEA,,,,安全的,,,,Stringr,,,,topgo |
链接 | |
建议 | 全部,,,,生物使用,,,,呼吸道,,,,HGU95AV2.DB |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | EnrichmentBrowser_1.2.2.2.tar.gz |
Windows二进制 | EnrichmentBrowser_1.2.2.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | EnrichmentBrowser_1.2.2.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | EnrichmentBrowser_1.2.2.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/enrichmentbrowser/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/enrichmentbrowser/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |