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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见ENmix．

Illumina HumanMethylation450 BeadChip的数据预处理和质量控制

Bioconductor版本:3.1

Illumina HumanMethylation450 BeadChip具有复杂的阵列设计，测量结果受实验变化的影响。ENmix R包提供了用于底层数据预处理的工具，以提高数据质量。它结合了一种基于模型的背景校正方法ENmix，提供了数组间分位数归一化、数据质量检查、多模态分布的cpg探索和数据变化来源等功能。为了支持大规模数据分析，该软件包还为一些常用的数据预处理方法提供了多处理器并行计算包装，如BMIQ探头设计类型偏差校正和ComBat批处理效果校正。

作者:徐宗礼[cre, aut]，牛亮[aut]，李乐平[ctb]， Jack Taylor [ctb]

维护者:徐宗丽

安装

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文档

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PDF	R脚本	ENmix用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，DNAMethylation，DataImport，MethylationArray，微阵列，归一化，OneChannel，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	minfi平行,doParallel，Biobase(> = 2.17.8),foreach
进口	质量，preprocessCore，西瓜，股东价值分析，geneplotter
链接
建议	minfiData(> = 0.4.1),RPMM，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	ENmix_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	ENmix_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ENmix_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	ENmix_1.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/ENmix/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ENmix/
软件包下载报告	下载数据