要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ENCODExplorer”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ENCODExplorer

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见ENCODExplorer

ENCODE元数据的编译

Bioconductor版本:3.1

这个包允许用户快速访问ENCODE项目文件元数据,并允许访问帮助函数来查询ENCODE rest api,下载ENCODE数据集并以SQLite格式保存数据库。

作者:Charles Joly Beauparlant < Charles。Joly-beauparlant at crchul. ulval .ca>,Audrey Lemacon and Arnaud Droit

维护者:Charles Joly Beauparlant < Charles。Joly-beauparlant at crchul. ulval .ca>

引文(从R内,输入引用(“ENCODExplorer”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ENCODExplorer”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ENCODExplorer”)

超文本标记语言 R脚本 数据更新
超文本标记语言 R脚本 数据库模型
超文本标记语言 R脚本 ENCODExplorer简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport基础设施软件
版本 1.0.6
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.2)
进口 工具,jsonliteRSQLite
链接
建议 RUnitBiocGenericsknitr旋度httr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/CharlesJB/ENCODExplorer/issues
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ENCODExplorer_1.0.6.tar.gz
Windows二进制 ENCODExplorer_1.0.6.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) ENCODExplorer_1.0.6.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) ENCODExplorer_1.0.6.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ENCODExplorer/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ENCODExplorer/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心