要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ENCODExplorer”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见ENCODExplorer.
Bioconductor版本:3.1
这个包允许用户快速访问ENCODE项目文件元数据,并允许访问帮助函数来查询ENCODE rest api,下载ENCODE数据集并以SQLite格式保存数据库。
作者:Charles Joly Beauparlant < Charles。Joly-beauparlant at crchul. ulval .ca>,Audrey Lemacon
维护者:Charles Joly Beauparlant < Charles。Joly-beauparlant at crchul. ulval .ca>
引文(从R内,输入引用(“ENCODExplorer”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ENCODExplorer”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ENCODExplorer”)
超文本标记语言 | R脚本 | 数据更新 |
超文本标记语言 | R脚本 | 数据库模型 |
超文本标记语言 | R脚本 | ENCODExplorer简介 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,软件 |
版本 | 1.0.6 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.2) |
进口 | 工具,jsonlite,RSQLite |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,旋度,httr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/CharlesJB/ENCODExplorer/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ENCODExplorer_1.0.6.tar.gz |
Windows二进制 | ENCODExplorer_1.0.6.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ENCODExplorer_1.0.6.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ENCODExplorer_1.0.6.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ENCODExplorer/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ENCODExplorer/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |