要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“肘”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见肘.
Bioconductor版本:3.1
肘部是一种改进的折叠变化检验,它使用聚类分析和模式识别来设置截断极限,直接从复制内方差中获得,而无需假设只有2个生物重复的正态分布。弯头在跨平台分析中也提供了与折叠测试相同的一致性。采用T检验和微阵列统计分析(12个重复,初始条件和最终条件各6个重复)对肘关节的假阳性和假阴性率进行评估时,肘关节的假阳性和假阴性率低于标准折叠试验。肘关节提供了一个基于初始条件复制的空值,并给出了结果的误差界限,以便更好地评估显著性。
作者:张向丽,Natalie Bjorklund, Graham Alvare, Tom Ryzdak, Richard Sparling, Brian Fristensky
维护者:Graham Alvare < Alvare at cc.umanitoba。张湘丽<张菊at cc.umanitoba.ca>
引文(从R内,输入引用(“肘部”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“肘”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“肘部”)
R脚本 | 使用肘部——肘部权威教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | GeneExpression,微阵列,多通道,OneChannel,RNASeq,测序,软件,技术,TwoChannel |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(2年) |
许可证 | 文件许可 |
取决于 | R (>= 2.15.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | DESeq,GEOquery,limma,simpleaffy,affyPLM,RColorBrewer |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ELBOW_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | ELBOW_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | ELBOW_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ELBOW_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ELBOW/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ELBOW/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |