要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ edda”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

埃达

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅埃达

差异丰度分析中的实验设计

生物导体版本:3.1

EDDA可以帮助设计一系列常见的实验,例如RNA-SEQ,纳米串试验,RIP-SEQ和元基因组测序,并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度的能力的影响。这项工作于2014年12月3日在基因组生物学上发表,标题为“研究设计对检测高通量实验中差异丰富特征的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/15/12/527)。

作者:Li Juntao,Luo Huaien,Chia Kuan Hui Burton,Niranjan Nagarajan

维护人员:chia kuan hui burton ,niranjan nagarajan

引用(从r内,输入引用(“ EDDA”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ EDDA”)

PDF R脚本 Edda Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,实验设计,,,,正常化,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(2年)
执照 GPL(> = 2)
要看 RCPP(> = 0.10.4),并行,方法,rocr,,,,deseq,,,,贝塞克,,,,,,,,EDGER
进口 图形,统计,UTIT,并行,方法,rocr,,,,deseq,,,,贝塞克,,,,,,,,EDGER
链接 RCPP
建议
系统要求
增强
URL http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 edda_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 edda_1.6.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) edda_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) edda_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/edda/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/edda/
软件包下载报告 下载统计

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