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此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅埃达。
生物导体版本:3.1
EDDA可以帮助设计一系列常见的实验,例如RNA-SEQ,纳米串试验,RIP-SEQ和元基因组测序,并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度的能力的影响。这项工作于2014年12月3日在基因组生物学上发表,标题为“研究设计对检测高通量实验中差异丰富特征的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/15/12/527)。
作者:Li Juntao,Luo Huaien,Chia Kuan Hui Burton,Niranjan Nagarajan
维护人员:chia kuan hui burton
引用(从r内,输入引用(“ EDDA”)
):
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Browsevignettes(“ EDDA”)
R脚本 | Edda Vignette | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,实验设计,,,,正常化,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(2年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | RCPP(> = 0.10.4),并行,方法,rocr,,,,deseq,,,,贝塞克,,,,雪,,,,EDGER |
进口 | 图形,统计,UTIT,并行,方法,rocr,,,,deseq,,,,贝塞克,,,,雪,,,,EDGER |
链接 | RCPP |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527 |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | edda_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | edda_1.6.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | edda_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | edda_1.6.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/edda/tree/release-3.1 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/edda/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |