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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见DiffBind．

ChIP-Seq峰值数据的差分绑定分析

Bioconductor版本:3.1

使用亲和(定量)数据从多个ChIP-seq实验中计算差异绑定位点。还支持占用(重叠)分析和绘图功能。

作者:Rory Stark< Rory。Stark在cruk.cam.ac。Gord Brown

维护者:Rory Stark< Rory。Stark在cruk.cam.ac.uk>

安装

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文档

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browseVignettes(“DiffBind”)

PDF	R脚本	DiffBind: ChIP-Seq峰值数据的差分绑定分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，DifferentialPeakCalling，测序，软件
版本	1.14.6
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.1.0)，GenomicRanges，limma，GenomicAlignments，locfit
进口	RColorBrewer，北极监测和评估方案，刨边机(> = 2.3.58),gplots， grDevices, stats, utils，IRanges，zlibbioc，晶格，systemPipeR、工具
链接	Rsamtools(> = 1.19.38)
建议	DESeq，Rsamtools，DESeq2，BiocStyle
SystemRequirements
增强了	rgl平行,BiocParallel，XLConnect
URL
全靠我	ChIPQC，MMDiff
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DiffBind_1.14.6.tar.gz
Windows二进制	DiffBind_1.14.6.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DiffBind_1.14.6.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DiffBind_1.14.6.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DiffBind/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DiffBind/
软件包下载报告	下载数据