要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源代码("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("DSS")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

DSS

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DSS

用于测序数据的色散收缩。

Bioconductor版本:3.1

DSS是一个R库,对基于计数的测序数据进行差分分析。它从RNA-seq中检测差异表达基因(DEGs),从亚硫酸氢盐测序(BS-seq)中检测差异甲基化位点或区域(DML/DMRs)。DSS的核心是一种新的从γ -泊松分布或β -二项分布估计弥散参数的弥散收缩方法。

作者:Hao Wu < Hao。吴:emory.edu >

维护人员:Hao Wu < Hao。吴:emory.edu >

引用(从R中,输入引用(DSS)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源代码("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("DSS")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes (DSS)

PDF R脚本 弥散收缩RNA-seq数据的差异表达
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeqDNAMethylationDifferentialExpressionRNASeq测序软件
版本 2.6.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 GPL
取决于 Biobasebsseq、样条函数、方法
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 适当的
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 DSS_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 DSS_2.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) DSS_2.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) DSS_2.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/DSS/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DSS/
包下载报告 下载数据

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支持»

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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心