要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ deseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

deseq

此软件包适用于生物导体的3.1版;对于稳定的最新版本,请参阅deseq

基于负二项式分布的差异基因表达分析

生物导体版本:3.1

估计来自高通量测序测定法的计数数据中的差异均值依赖性,并基于模型使用负二项式分布测试差异表达

作者:西蒙·安德斯(Simon Anders),embl heidelberg

维护者:Simon Anders

引用(从r内,输入引用(“ deseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ deseq”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ deseq”)

PDF R脚本 用“ DESEQ”软件包分析RNA-Seq数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,差异性,,,,rnaseq,,,,智者,,,,测序,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(6年)
执照 GPL(> = 3)
要看 生物基因(> = 0.7.5),生物酶(> = 2.21.7),Locfit,,,,格子
进口 GeneFilter,,,,Geneplotter, 方法,大量的,,,,rcolorbrewer
链接
建议 帕西拉(> = 0.2.10),VSN,,,,GPLOTS
系统要求
增强
URL http://www-huber.embl.de/users/anders/deseq
取决于我 dbchip,,,,埃达,,,,metaseqr,,,,polyfit,,,,seqgsea,,,,TCC,,,,翻译
进口我 ampliqueso,,,,arrayexpresshts,,,,EasyRnaseq,,,,EDASEQ,,,,埃达,,,,GCMAP,,,,htsfilter,,,,RNASEQMAP,,,,topaseq
建议我 bitseq,,,,compcoder,,,,deseq2,,,,葡萄,,,,差异,,,,弯头,,,,量规,,,,GeneFilter,,,,基因组签名,,,,基因组机,,,,Onechannelgui,,,,帕西拉,,,,恰当的,,,,Ruvseq,,,,SSPA
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 deseq_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 deseq_1.20.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) deseq_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) deseq_1.20.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/deseq/tree/release-3.1
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/deseq/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心