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deseq
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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅deseq。
基于负二项式分布的差异基因表达分析
生物导体版本：3.1
估计来自高通量测序测定法的计数数据中的差异均值依赖性，并基于模型使用负二项式分布测试差异表达
作者：西蒙·安德斯（Simon Anders），embl heidelberg
维护者：Simon Anders
引用（从r内，输入引用（“ deseq”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ deseq”）
| R脚本 | 用“ DESEQ”软件包分析RNA-Seq数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，差异性，，，，rnaseq，，，，智者，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.6（R-2.11）（6年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | 生物基因（> = 0.7.5），生物酶（> = 2.21.7），Locfit，，，，格子 |
| 进口 | GeneFilter，，，，Geneplotter， 方法，大量的，，，，rcolorbrewer |
| 链接 | |
| 建议 | 帕西拉（> = 0.2.10），VSN，，，，GPLOTS |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www-huber.embl.de/users/anders/deseq |
| 取决于我 | dbchip，，，，埃达，，，，metaseqr，，，，polyfit，，，，seqgsea，，，，TCC，，，，翻译 |
| 进口我 | ampliqueso，，，，arrayexpresshts，，，，EasyRnaseq，，，，EDASEQ，，，，埃达，，，，GCMAP，，，，htsfilter，，，，RNASEQMAP，，，，topaseq |
| 建议我 | bitseq，，，，compcoder，，，，deseq2，，，，葡萄，，，，差异，，，，弯头，，，，量规，，，，GeneFilter，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，Onechannelgui，，，，帕西拉，，，，恰当的，，，，Ruvseq，，，，SSPA |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | deseq_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | deseq_1.20.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | deseq_1.20.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | deseq_1.20.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/deseq/tree/release-3.1 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/deseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
