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这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本，请参见DEGreport．

DEG分析报告

Bioconductor版本:3.1

创建计数数据差异表达式分析的HTML报告。它集成了DESeq2和edgeR小插图中提到的一些代码，并根据每个选定基因的折叠变化平均值和变异性报告了一个排序的基因列表。

作者:Lorena Pantano

维护者:Lorena Pantano < Lorena。Pantano在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“DEGreport”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DEGreport”)

PDF	R脚本	DEGreport
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，ReportWriting，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.0.0)，rjags，quantreg
进口	plyr跑龙套,ggplot2，喷嘴。R1，coda，刨边机
链接
建议	knitr，biomaRt，RUnit，BiocStyle，BiocGenerics，BiocParallel
SystemRequirements	捷豹(>= 3.0.0)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DEGreport_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	DEGreport_1.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DEGreport_1.2.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	DEGreport_1.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DEGreport/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEGreport/
软件包下载报告	下载数据