要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CancerMutationAnalysis”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

CancerMutationAnalysis

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见CancerMutationAnalysis

癌症突变分析

Bioconductor版本:3.1

该软件包实现了癌症体细胞突变研究的基因和基因集水平分析方法。基因水平的方法区分驱动基因(在肿瘤发生中起积极作用)和乘客基因(在肿瘤样本中突变,但在肿瘤发生中没有作用),并纳入两阶段研究设计。基因集方法实现了一种面向患者的方法,该方法为每个样本计算基因集得分,然后在整个样本中组合它们;还提供了使用Wilcoxon检验的基因导向方法进行比较。

作者:乔瓦尼·帕尔玛吉亚尼,西米娜·m·博卡

维护者:Simina M. Boca < Simina。博卡在nih.gov>

引文(从R内,输入引用(“CancerMutationAnalysis”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CancerMutationAnalysis”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CancerMutationAnalysis”)

PDF CancerMutationAnalysisTutorial
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 遗传学软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证 GPL(>= 2) +文件许可
取决于 R (>= 2.10.0),qvalue
进口 AnnotationDbilimma、方法、统计
链接
建议 KEGG.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 CancerMutationAnalysis_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 CancerMutationAnalysis_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) CancerMutationAnalysis_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) CancerMutationAnalysis_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/CancerMutationAnalysis/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerMutationAnalysis/
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