要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CancerMutationAnalysis”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见CancerMutationAnalysis.
Bioconductor版本:3.1
该软件包实现了癌症体细胞突变研究的基因和基因集水平分析方法。基因水平的方法区分驱动基因(在肿瘤发生中起积极作用)和乘客基因(在肿瘤样本中突变,但在肿瘤发生中没有作用),并纳入两阶段研究设计。基因集方法实现了一种面向患者的方法,该方法为每个样本计算基因集得分,然后在整个样本中组合它们;还提供了使用Wilcoxon检验的基因导向方法进行比较。
作者:乔瓦尼·帕尔玛吉亚尼,西米娜·m·博卡
维护者:Simina M. Boca < Simina。博卡在nih.gov>
引文(从R内,输入引用(“CancerMutationAnalysis”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“CancerMutationAnalysis”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“CancerMutationAnalysis”)
CancerMutationAnalysisTutorial | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 遗传学,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 2.10 (R-2.15)(4年) |
许可证 | GPL(>= 2) +文件许可 |
取决于 | R (>= 2.10.0),qvalue |
进口 | AnnotationDbi,limma、方法、统计 |
链接 | |
建议 | KEGG.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | CancerMutationAnalysis_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | CancerMutationAnalysis_1.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CancerMutationAnalysis_1.12.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | CancerMutationAnalysis_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/CancerMutationAnalysis/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CancerMutationAnalysis/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |