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卡格
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此软件包适用于生物导体的3.1版；对于稳定的最新版本，请参阅卡格。
分析CAGE（基因表达的CAP分析）测序数据，以精确的转录起始位点和启动性挖掘
生物导体版本：3.1
笼子测序数据的预处理，转录起始位点的识别和归一化以及转录起始位点簇的下游分析（启动子）。
作者：挪威卑尔根大学生物学系Vanja Haberle
维护者：vanja haberle
引用（从r内，输入引用（“ Cager”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Cager”）
| R脚本 | 卡格 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 聚类，，，，高通量序列，，，，预处理，，，，测序，，，，软件，，，，转录，，，，可视化 |
| 版本 | 1.10.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（3年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | 方法，r（> = 2.15.0），BSGENOME |
| 进口 | utils，rsamtools，，，，基因组机，，，，iranges，，，，Data.Table，，，，beanplot，，，，rtracklayer，，，，SOM，，，，VGAM |
| 链接 | |
| 建议 | BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER7，，，，fantom3and4cage |
| 系统要求 | |
| 增强 | 平行 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | seqpattern |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | cager_1.10.1.tar.gz |
| Windows二进制 | cager_1.10.1.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | cager_1.10.1.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | cager_1.10.1.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/cager/tree/release-3.1 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cager/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
