要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("CAFE")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见咖啡馆.
Bioconductor版本:3.1
使用Affymetrix表达微阵列作为输入检测和可视化总的染色体畸变
作者:桑德博伦
维护者:Sander Bollen < Sander .h。博伦在gmail.com >
引用(从R中,输入引用(“咖啡馆”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("CAFE")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“咖啡馆”)
R脚本 | 手册 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GeneSetEnrichment,微阵列,OneChannel,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (R-3.1)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 2.10),biovizBase,GenomicRanges,IRanges,ggbio |
进口 | affy,ggplot2,注释、网格gridExtratcltk,Biobase |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | CAFE_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | CAFE_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | CAFE_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | CAFE_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/CAFE/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CAFE/ |
包下载报告 | 下载数据 |