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此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本，请参见生命网络．

生物网络功能分析的例程

Bioconductor版本:3.1

该软件包提供了蛋白质-蛋白质相互作用网络的综合分析和功能模块的检测功能。通过将统计检验的p值分配给网络节点，可以将不同的数据集集成到网络中。例如，从Affymetrix阵列的基因的差异表达中获得的p值被分配到网络的节点上。通过拟合-均匀混合模型，从p值计算得分，可以计算出网络区域的总体得分，并通过整数线性规划算法确定最大得分子网络。

作者:Marcus Dittrich和Daniela Beisser

维护者:马库斯·迪特里奇<马库斯。在biozentrum.uni-wuerzburg.de > >

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("BioNet")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“生命网络”)

PDF	R脚本	生命网络教程
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，DifferentialExpression，GeneExpression，GraphAndNetwork，微阵列，网络，NetworkEnrichment，软件
版本	1.29.1
Bioconductor自	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0),图，RBGL
进口	igraph(> = 1.0.1),AnnotationDbi，Biobase
链接
建议	rgl，嫁祸于，DLBCL，genefilter，xtable，所有，limma，hgu95av2.db，XML
SystemRequirements
增强了
URL	http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
取决于我
进口我	HTSanalyzeR
建议我	圣诞老人
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	BioNet_1.29.1.tar.gz
Windows二进制	BioNet_1.29.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)	BioNet_1.29.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	BioNet_1.29.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/BioNet/tree/release-3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioNet/
包下载报告	下载数据