要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BaseSpaceR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见BaseSpaceR.
Bioconductor版本:3.1
丰富的R接口到Illumina的BaseSpace云计算环境,支持快速开发数据分析和可视化工具。
作者:Adrian Alexa
维护者:Jared O'Connell
引文(从R内,输入引用(“BaseSpaceR”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BaseSpaceR”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BaseSpaceR”)
R脚本 | BaseSpaceR | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ConnectTools,DataImport,DataRepresentation,遗传学,HighThroughputSequencing,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.12.1 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | Apache License 2.0 |
取决于 | R (>= 2.15.0),RCurl,RJSONIO |
进口 | 方法 |
链接 | |
建议 | RUnit,IRanges,Rsamtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | BaseSpaceR_1.12.1.tar.gz |
Windows二进制 | BaseSpaceR_1.12.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | BaseSpaceR_1.12.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | BaseSpaceR_1.12.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/BaseSpaceR/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BaseSpaceR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |