要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“注解forge”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

AnnotationForge

这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见AnnotationForge

构建注释数据库包的代码

Bioconductor版本:3.1

提供用于生成Annotation包及其数据库的代码。生成的包将与AnnotationDbi一起使用。

作者:Marc Carlson, Herve Pages

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“AnnotationForge”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“注解forge”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AnnotationForge”)

PDF R脚本 AnnotationForge:为自定义标注资源创建选择接口
PDF R脚本 创建探测包
PDF R脚本 SQLForge:使用标准数据库模式创建新注释包的简单方法。
超文本标记语言 R脚本 制造新的生物包装
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释基础设施软件
版本 1.10.1
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.7.0),方法,utils,BiocGenerics(> = 0.1.13),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.19.15),org.Hs.eg.db
进口 方法,跑龙套,DBIRSQLiteBiocGenericsS4VectorsBiobase
链接
建议 DBI(> = 0.2 4),RSQLite(> = 0.6 4),XMLRCurlhgu95av2.dbhuman.db0affyHomo.sapienshom.Hs.inp.dbGO.dbBiocStyleknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 GGHumanMethCancerPanelv1.dbGOstats
建议我 AnnotationDbiAnnotationHub
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 AnnotationForge_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 AnnotationForge_1.10.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) AnnotationForge_1.10.1.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) AnnotationForge_1.10.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/AnnotationForge/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationForge/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心