要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“注解forge”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.1版;有关稳定的最新发布版本,请参见AnnotationForge.
Bioconductor版本:3.1
提供用于生成Annotation包及其数据库的代码。生成的包将与AnnotationDbi一起使用。
作者:Marc Carlson, Herve Pages
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“AnnotationForge”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“注解forge”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AnnotationForge”)
R脚本 | AnnotationForge:为自定义标注资源创建选择接口 | |
R脚本 | 创建探测包 | |
R脚本 | SQLForge:使用标准数据库模式创建新注释包的简单方法。 | |
超文本标记语言 | R脚本 | 制造新的生物包装 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,基础设施,软件 |
版本 | 1.10.1 |
在Bioconductor | BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.7.0),方法,utils,BiocGenerics(> = 0.1.13),Biobase(> = 1.17.0),AnnotationDbi(> = 1.19.15),org.Hs.eg.db |
进口 | 方法,跑龙套,DBI,RSQLite,BiocGenerics,S4Vectors,Biobase |
链接 | |
建议 | DBI(> = 0.2 4),RSQLite(> = 0.6 4),XML,RCurl,hgu95av2.db,human.db0,affy,Homo.sapiens,hom.Hs.inp.db,GO.db,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | GGHumanMethCancerPanelv1.db,GOstats |
建议我 | AnnotationDbi,AnnotationHub |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | AnnotationForge_1.10.1.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationForge_1.10.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | AnnotationForge_1.10.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | AnnotationForge_1.10.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/AnnotationForge/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationForge/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |