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这个包是3.1版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AllelicImbalance。

调查特定等位基因表达

Bioconductor版本:3.1

提供了一个框架为等位基因的特定表达式使用RNA-seq数据调查。

作者:Jesper R Gadin Lasse Folkersen

维护人员:Jesper R Gadin <,在gmail.com gadin >

安装

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文档

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PDF		AllelicImbalance-vignette.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学,基础设施,测序,软件
版本	1.6.2
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(> = 3.1.0)、网格GenomicRanges,GenomicAlignments,VariantAnnotation,Gviz
进口	方法,BiocGenerics,AnnotationDbi,Biostrings,S4Vectors,IRanges,Rsamtools,GenomicFeatures,Gviz,晶格,seqinr,GenomeInfoDb,VariantAnnotation
链接
建议	testthat,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608,knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/pappewaio/AllelicImbalance
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	AllelicImbalance_1.6.2.tar.gz
Windows二进制	AllelicImbalance_1.6.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	AllelicImbalance_1.6.2.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	AllelicImbalance_1.6.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/allelicimbalance/tree/release - 3.1
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AllelicImbalance/
包下载报告	下载数据