要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AIMS")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见目标.
Bioconductor版本:3.1
这个包包含AIMS实现。它包含了分配五个固有分子亚型(Luminal A, Luminal B, her2富集,Basal-like, Normal-like)的必要功能。分配可以在个体样本上完成,也可以在基因表达数据集上完成。
作者:Eric R. Paquet, Michael T. Hallett
维护者:Eric R Paquet < Eric . R。Paquet在gmail.com>
引用(从R中,输入引用(“目的”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AIMS")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“目的”)
R脚本 | 前言(HowTo) | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 |
biocViews | 分类,GeneExpression,微阵列,RNASeq,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.1 (R-3.2)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),e1071,Biobase |
进口 | |
链接 | |
建议 | breastCancerVDX,hgu133a.db,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.bci.mcgill.ca/AIMS |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | AIMS_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | AIMS_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | AIMS_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | AIMS_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/AIMS/tree/release-3.1 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AIMS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |