要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AIMS")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

目标

此包适用于Bioconductor的3.1版本;有关稳定的最新发布版本,请参见目标

目的:确定乳腺癌固有分子亚型的绝对归属

Bioconductor版本:3.1

这个包包含AIMS实现。它包含了分配五个固有分子亚型(Luminal A, Luminal B, her2富集,Basal-like, Normal-like)的必要功能。分配可以在个体样本上完成,也可以在基因表达数据集上完成。

作者:Eric R. Paquet, Michael T. Hallett

维护者:Eric R Paquet < Eric . R。Paquet在gmail.com>

引用(从R中,输入引用(“目的”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("AIMS")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“目的”)

PDF R脚本 前言(HowTo)
PDF 参考手册
文本 自述

细节

biocViews 分类GeneExpression微阵列RNASeq软件
版本 1.0.0
在Bioconductor公司 BioC 3.1 (R-3.2)(1年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),e1071Biobase
进口
链接
建议 breastCancerVDXhgu133a.dbRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bci.mcgill.ca/AIMS
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 AIMS_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 AIMS_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) AIMS_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) AIMS_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/AIMS/tree/release-3.1
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AIMS/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心