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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ccTutorial。

数据包ChIP-chip教程

Bioconductor版本:3.0

这个数据包伴随ChIP-chip教程,已经发表在PLoS计算生物学。这个包中的数据和源代码允许读者完全复制本教程中的步骤。

作者:Joern Toedling,沃尔夫冈•休伯

维护人员:Joern Toedling < Joern。在curie.fr toedling >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ccTutorial”)

文档

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browseVignettes (“ccTutorial”)

PDF	R脚本	关于如何分析的教程使用Bioconductor ChIP-chip读数
PDF	R脚本	补充一个教程如何分析使用Bioconductor ChIP-chip读数
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPchipData,ExperimentData
版本	1.3.1
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),林格(> = 1.9.8),affy(> = 1.23.4),topGO(> = 1.13.1)
进口	Biobase
链接
建议	biomaRt,Biobase(> = 2.5.5),xtable
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ccTutorial_1.3.1.tar.gz
Windows二进制	ccTutorial_1.3.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ccTutorial_1.3.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	ccTutorial_1.3.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ccTutorial/
包下载报告	下载数据