要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427。
生物导体版本:3.0
从DBSNP Build 131:Human_9606(基于GRCH37)提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因。NCBI于2010年3月24日至26日创建了用于此软件包的源数据文件。警告:该软件包中的SNP基于GRCH37基因组。请注意,除线粒体染色体外,GRCH37基因组与UCSC的HG19基因组相同。因此,该软件包中的SNP可以“注入” bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中,但是该注入将排除CHRM(即,该序列中不会注入任何内容)。
作者:Herve页面
维护者:H。页面
引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427”)
参考手册 |
生物浏览 | AnnotationData,,,,遗传学,,,,homo_sapiens |
版本 | 0.99.6 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),iranges,,,,基因组机 |
进口 | 方法,iranges,,,,基因组机 |
链接 | |
建议 | 生物弦,,,,BSGENOME(> = 1.16.1),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BSGENOME |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427_0.99.6.tar.gz |
Windows二进制 | snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427_0.99.6.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427_0.99.6.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427_0.99.6.tgz |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp.20100427/ |
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