1.7版。xx(2014-05-07) +增加功能plotBubble + fitPA增加并行(多核)选项，fitDO +修复了fitMeta的错误，当useCSSoffset=FALSE和模型矩阵ncol==2 +(1.7.10)更新了默认分位数估计(.5)的低估计+(1.7.10)增加了简短的说明如何做多组比较+ (1.7.15)fitZig (eb)的输出现在是limma::eBayes的结果，而不是limma::eBayes + (1.7.16) plotMRheatmap允许排序的任何stat(不只是sd) + (1.7.18) fitTimeSeries包括时间序列方法差异丰富的时间间隔+(1.7.20)固定OTU级别时间序列分析的小bug，增加了plotClassTimeSeries +(1.7.26)，在cumNormStat中增加了任何样本为空的警告/修复+(1.7.27)，增加了一些单元测试+(1.7.29)，增加了interactiveDisplay到命名空间(显示功能允许通过浏览器进行交互式探索/绘图)1.5版。xx(2014-04-17) +结合biom2mreexperiment、MRexperiment2biom和load_biome功能的生物格式支持。+增加了uniqueFeatures, filterData, aggregateByTaxonomy / aggTax, plotFeature和calculateeffecvesamples函数。+将MRfisher重命名为fitPA(存在-缺席fisher测试)。+增加归一化警告+增加fitDO(发现比值比测试)和fitMeta(原始转移)。+添加match.call()信息到fitZig输出+固定丢失的E-Step边界1.2版。xx(2013-08-20) +我们的论文被录用了!+增加了mre实验对象的方法(colsum,colMeans, rowsum,rowMeans，用法例如colsum (obj)或colsum (obj,norm=TRUE))(09-25) +增加了两个新函数，plotOrd和plotRare -一个绘制PCA/MDS坐标和精简效果的函数(09-04,09-18)+更新MRfisher，包括存在-缺席测试的阈值(08-19)+更新注释(roxygen2)风格的所有函数使用Rd2roxygen包(07-13)+更新plotCorr和plotMRheatmap，以允许各种颜色/不需要试验(07-13)+重写vignette(并切换到knitr) 1.1版。xx(最后更新2013-06-25)+改写load_meta和load_metaQ快/使用更少内存+修改cumNormStat移除NA样本计算(例子是样品没有任何项)+重新添加plotGenus的抖动+固定电话uniqueNames先生表+改变由于Kasper丹尼尔·汉森的建议如下: plotOTU and plotGenus both have much better auto-generated axis MRtable, MRfulltable, MRcoefs have a sort by p-value option now MRtable, MRfulltable, MRcoefs now have an extra option to include unique numbers for OTU features (default would automatically add them previously) cumNorm.R - now returns the object as well - not just replacing the environment 0 Still need to turn the fitZig output to S3, consider subsetting function address low p-values version 1.0.0: (2013-03-29) + Release!