要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ xcms”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

XCMS

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅XCMS

LC/MS和GC/MS数据分析

生物导体版本:3.0

色谱分离和单光谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NETCDF,MZXML,MZDATA和MZML文件中导入。预处理数据,用于高通量,未定位的分析物分析。

作者:Colin A. Smith ,ralf tautenhahn > gmail.com>,Steffen Neumann ,Paul Benton 在ucdavis.edu>

维护者:ralf tautenhahn

引用(从r内,输入引用(“ XCMS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ xcms”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

BrowseVignettes(“ XCMS”)

PDF R脚本 将FTICR-MS数据与XCMS分组
PDF R脚本 XCMS的安装说明
PDF R脚本 LC/MS使用XCMS进行预处理和分析
PDF R脚本 使用XCMS处理串联MS和MS $^n $数据
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 质谱,,,,代谢组学,,,,软件
版本 1.42.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年)
执照 GPL(> = 2) +文件许可证
要看 R(> = 2.14.0),方法,MZR(> = 1.1.6),生物基因,,,,生物酶
进口
链接
建议 法阿科,,,,MSDATA,ncdf,多检验,,,,RGL,,,,MassSpececebeet(> = 1.5.2),拉恩,,,,运行
系统要求
增强 rgraphviz,,,,rmpi,,,,XML
URL http://metlin.scripps.edu/download/https://github.com/sneumann/xcms
取决于我 相机,,,,法阿科,,,,弗拉姆,,,,变代,,,,metams
进口我 相机,,,,Cosmiq,,,,梅特,,,,Risa
建议我 MassSpececebeet,,,,MSDATA,,,,rforpoteomics,,,,rmassbank
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 xcms_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 XCMS_1.42.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) XCMS_1.42.0.TGZ
Mac OS X 10.9(Mavericks) XCMS_1.42.0.TGZ
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/xcms/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/xcms/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

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支持»

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网
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