要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ triplex”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅三元。
生物导体版本:3.0
该软件包提供了用于识别和可视化DNA序列中潜在分子内三形模式的功能。主要功能是检测能够以更大的序列折叠成分子内三分(H-DNA)的子序列的位置。电势H-DNA(三)应由尽可能多的炮核苷酸三重态制成。该软件包包括可视化,显示1D,2D或3D中的确切基本配对。
作者:Jiri Hon,Matej Lexa,Tomas Martinek和Kamil Rajdl的贡献
维护者:jiri hon
引用(从r内,输入引用(“三重”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Triplex”)
R脚本 | Triplex用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 结肠管制,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(3年) |
执照 | BSD_2_Clause +文件许可证 |
要看 | r(> = 2.15.0),S4VECTORS,,,,iranges(> = 1.99.1),xvector(> = 0.5.3),生物弦(> = 2.33.3) |
进口 | 方法,网格,基因组机 |
链接 | S4VECTORS,,,,iranges,,,,xvector,,,,生物弦 |
建议 | RGL(> = 0.93.932),bsgenome.celegans.ucsc.ce10,,,,rtracklayer,,,,基因组 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.fi.muni.cz/~lexa/triplex/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | triplex_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | triplex_1.6.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | triplex_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | triplex_1.6.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/triplex/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/triplex/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |