要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ triplex”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

三元

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅三元

在DNA中搜索和可视化分子内三形形成序列

生物导体版本:3.0

该软件包提供了用于识别和可视化DNA序列中潜在分子内三形模式的功能。主要功能是检测能够以更大的序列折叠成分子内三分(H-DNA)的子序列的位置。电势H-DNA(三)应由尽可能多的炮核苷酸三重态制成。该软件包包括可视化,显示1D,2D或3D中的确切基本配对。

作者:Jiri Hon,Matej Lexa,Tomas Martinek和Kamil Rajdl的贡献

维护者:jiri hon

引用(从r内,输入引用(“三重”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ triplex”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Triplex”)

PDF R脚本 Triplex用户指南
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 结肠管制,,,,测序,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 BSD_2_Clause +文件许可证
要看 r(> = 2.15.0),S4VECTORS,,,,iranges(> = 1.99.1),xvector(> = 0.5.3),生物弦(> = 2.33.3)
进口 方法,网格,基因组机
链接 S4VECTORS,,,,iranges,,,,xvector,,,,生物弦
建议 RGL(> = 0.93.932),bsgenome.celegans.ucsc.ce10,,,,rtracklayer,,,,基因组
系统要求
增强
URL http://www.fi.muni.cz/~lexa/triplex/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 triplex_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 triplex_1.6.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) triplex_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) triplex_1.6.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/triplex/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/triplex/
软件包下载报告 下载统计

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