要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tracktables”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

tracktables

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tracktables

构建IGV跟踪和HTML报告

Bioconductor版本:3.0

在HTML页面中创建复杂IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。

作者:Tom Carroll, Sanjay Khadayate, Anne Pajon,梁紫薇

维护者:Tom Carroll

引文(从R内,输入引用(“tracktables”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tracktables”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“tracktables”)

PDF R脚本 创建带有跟踪表的IGV HTML报告
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ReportWriting测序软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 R (>= 3.0.0)
进口 IRangesGenomicRangesXVectorRsamtoolsXMLtractor.basestringrRColorBrewer、方法
链接
建议 knitrBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 tracktables_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 tracktables_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) tracktables_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) tracktables_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/tracktables/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心