要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tracktables”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见tracktables.
Bioconductor版本:3.0
在HTML页面中创建复杂IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。
作者:Tom Carroll, Sanjay Khadayate, Anne Pajon,梁紫薇
维护者:Tom Carroll
引文(从R内,输入引用(“tracktables”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“tracktables”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“tracktables”)
R脚本 | 创建带有跟踪表的IGV HTML报告 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ReportWriting,测序,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年) |
许可证 | GPL (>= 3) |
取决于 | R (>= 3.0.0) |
进口 | IRanges,GenomicRanges,XVector,Rsamtools,XML,tractor.base,stringr,RColorBrewer、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | tracktables_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | tracktables_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | tracktables_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | tracktables_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/tracktables/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |