要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ topgo”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

topgo

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅topgo

Topgo:基因本体论的富集分析

生物导体版本:3.0

Topgo软件包提供了用于测试GO术语的工具,同时考虑GO图的拓扑结构。可以实施和应用不同的测试统计数据和不同的方法来消除GO术语之间的局部相似性和依赖性。

作者:Adrian Alexa,Jorg Rahnenfuhrer

维护者:gmail.com上的Adrian Alexa

引用(从r内,输入引用(“ Topgo”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ topgo”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Topgo”)

PDF R脚本 topgo
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,软件,,,,可视化
版本 2.18.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(9年)
执照 LGPL
要看 R(> = 2.10.0),方法,图形(> = 1.14.0),生物酶(> = 2.0.0),go.db(> = 2.3.0),AnnotationDbi(> = 1.7.19),Sparsem(> = 0.73)
进口 方法,图形,,,,生物酶,,,,Sparsem,,,,AnnotationDbi,,,,格子
链接
建议 全部,,,,HGU95AV2.DB,,,,HGU133A.DB,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,多检验,,,,rgraphviz,,,,全球测试
系统要求
增强
URL
取决于我 CCTORIAL,,,,Compepitools,,,,rnaither,,,,翻译
进口我 戈西姆,,,,MVGST
建议我 fgnet,,,,mirnatap,,,,林戈
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 topgo_2.18.0.tar.gz
Windows二进制 topgo_2.18.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) topgo_2.18.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) topgo_2.18.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/topgo/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/topgo/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
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弗雷德·哈钦森癌症研究中心