要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ topgo”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅topgo。
生物导体版本:3.0
Topgo软件包提供了用于测试GO术语的工具,同时考虑GO图的拓扑结构。可以实施和应用不同的测试统计数据和不同的方法来消除GO术语之间的局部相似性和依赖性。
作者:Adrian Alexa,Jorg Rahnenfuhrer
维护者:gmail.com上的Adrian Alexa
引用(从r内,输入引用(“ Topgo”)
):
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Browsevignettes(“ Topgo”)
R脚本 | topgo | |
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 2.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(9年) |
执照 | LGPL |
要看 | R(> = 2.10.0),方法,图形(> = 1.14.0),生物酶(> = 2.0.0),go.db(> = 2.3.0),AnnotationDbi(> = 1.7.19),Sparsem(> = 0.73) |
进口 | 方法,图形,,,,生物酶,,,,Sparsem,,,,AnnotationDbi,,,,格子 |
链接 | |
建议 | 全部,,,,HGU95AV2.DB,,,,HGU133A.DB,,,,GeneFilter,,,,Xtable,,,,多检验,,,,rgraphviz,,,,全球测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | CCTORIAL,,,,Compepitools,,,,rnaither,,,,翻译 |
进口我 | 戈西姆,,,,MVGST |
建议我 | fgnet,,,,mirnatap,,,,林戈 |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | topgo_2.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | topgo_2.18.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | topgo_2.18.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | topgo_2.18.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/topgo/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/topgo/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |