要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“spliceR”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见连接工具.
Bioconductor版本:3.0
一个用于从RNA-seq数据中分类备选剪接和预测编码潜力的R包。
作者:Johannes Waage < Johannes。工资在gmail.com>, Kristoffer Vitting-Seerup
维护者:Johannes Waage < Johannes。工资在gmail.com>, Kristoffer Vitting-Seerup
引文(从R内,输入引用(“连接工具”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“spliceR”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“连接工具”)
R脚本 | 连接工具装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,GeneExpression,测序,软件,转录,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R(>= 2.15.0),方法,腰带,rtracklayer,维恩图,RColorBrewer,plyr |
进口 | GenomicRanges,IRanges |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | spliceR_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | spliceR_1.8.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | spliceR_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | spliceR_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/spliceR/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/spliceR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |