要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“安全”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见安全.
Bioconductor版本:3.0
SAFE是一种在基因表达实验中检测功能类别的基于重采样的方法。SAFE可以应用于2样本和多类比较,或简单的线性回归。其他的实验设计也可以通过用户定义的功能来实现。
作者:威廉·巴里
维护人员:William T. Barry
引用(从R中,输入引用(“安全”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“安全”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“安全”)
R脚本 | 安全手册 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneSetEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod |
版本 | 3.6.1 |
在Bioconductor公司 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.4.0),AnnotationDbi,Biobase、方法、SparseM |
进口 | |
链接 | |
建议 | GO.db,PFAM.db,reactome.db,hgu133a.db,breastCancerUPP,生存,foreach,doRNG,Rgraphviz,GOstats |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | EnrichmentBrowser |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | safe_3.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | safe_3.6.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | safe_3.6.1.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | safe_3.6.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/safe/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/safe/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |