要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“安全”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

安全

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见安全

功能与表达的显著性分析

Bioconductor版本:3.0

SAFE是一种在基因表达实验中检测功能类别的基于重采样的方法。SAFE可以应用于2样本和多类比较,或简单的线性回归。其他的实验设计也可以通过用户定义的功能来实现。

作者:威廉·巴里

维护人员:William T. Barry

引用(从R中,输入引用(“安全”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“安全”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“安全”)

PDF R脚本 安全手册
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneSetEnrichment通路软件StatisticalMethod
版本 3.6.1
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.4.0),AnnotationDbiBiobase、方法、SparseM
进口
链接
建议 GO.dbPFAM.dbreactome.dbhgu133a.dbbreastCancerUPP生存foreachdoRNGRgraphvizGOstats
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 EnrichmentBrowser
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 safe_3.6.1.tar.gz
Windows二进制 safe_3.6.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) safe_3.6.1.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) safe_3.6.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/safe/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/safe/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心