##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("rtracklayer")

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rtracklayer．

基因组浏览器的R接口及其注释跟踪

Bioconductor版本:3.0

可扩展的框架，用于与多个基因组浏览器交互(目前UCSC内置)，并以各种格式操作注释轨道(目前GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig和2bit内置)。用户可以从支持的浏览器导出/导入音轨，以及查询和修改浏览器的状态，如当前的视口。

作者:迈克尔·劳伦斯，文斯·凯里，罗伯特·绅士

维护者:Michael Lawrence

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("rtracklayer")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“rtracklayer”)

PDF	R脚本	rtracklayer
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，DataImport，软件，可视化
版本	1.26.3
在Bioconductor公司	BioC 2.2 (R-2.7)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.10)，方法，GenomicRanges(> = 1.17.39)
进口	XML(1.98 > = 0),BiocGenerics(> = 0.11.3),S4Vectors(> = 0.2.3),IRanges(> = 1.99.28),XVector(> = 0.5.8),GenomeInfoDb(> = 1.1.19),Biostrings(> = 2.33.14),zlibbioc，RCurl(> = 1.4 2),Rsamtools(> = 1.17.8),GenomicAlignments(>= 1.1.16)，工具
链接	S4Vectors，IRanges，XVector
建议	BSgenome(> = 1.33.4),humanStemCell，微(> = 1.1.1),genefilter，limma，org.Hs.eg.db，hgu133plus2.db，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	BSgenome，CoverageView，腰带，EatonEtAlChIPseq，exomePeak，GenomicFiles，groHMM，IdeoViz，metagene，MethylSeekR，r3Cseq，RIPSeeker，连接工具
进口我	舞会礼服，BiSeq，BSgenome，篮球选手，卡斯珀，CexoR，ChIPseeker，ChromHeatMap，cn，CompGO，customProDB，derfinder，FourCSeq，FunciSNP，FunciSNP.data，geneLenDataBase，GenomicFeatures，GenomicInteractions，ggbio，GGtools，gmapR，哥特，Gviz，gwascat，hiAnnotator，HiTC，HTSeqGenie，MEDIPS，methyAnalysis，MotifDb，proBAMr，Repitools，咆哮，seqplots，SGSeq，TFBSTools，trackViewer，VariantAnnotation，VariantTools，wavClusteR
建议我	biovizBase，compEpiTools，FDb.FANTOM4.promoters.hg19，GenomicAlignments，GenomicRanges，ggtut，goseq，ind1KG，interactiveDisplay，metaseqR，methylumi，MotIV，NarrowPeaks，oneChannelGUI，图片，平，QuasR，R453Plus1Toolbox，林格，rMAT，RSVSim，三层，TSSi
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源	rtracklayer_1.26.3.tar.gz
Windows二进制	rtracklayer_1.26.3.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)	rtracklayer_1.26.3.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队)	rtracklayer_1.26.3.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/rtracklayer/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rtracklayer/
软件包下载报告	下载数据