要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("rfPred")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rfPred.
Bioconductor版本:3.0
基于外部大量的数据文件,其中rfPred评分预先计算了人类外显子组的所有基因组位置,包给出了由染色体、位置(hg19版本)、参考核苷酸和替代核苷酸以及蛋白质的uniprot标识符识别的错义变体的rfPred评分。注意,要使用这个包,用户必须连接到Internet或下载TabixFile和索引(大约3.3 Go)。
作者:Fabienne Jabot-Hanin, Hugo Varet和Jean-Philippe Jais
维护者:Hugo Varet
引用(从R中,输入引用(“rfPred”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("rfPred")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“rfPred”)
R脚本 | CalculatingrfPredscoreswithpackagerfPred | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,分类,软件 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL (>=2) |
取决于 | Rsamtools,GenomicRanges,IRanges,data.table方法,并行 |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.sbim.fr/rfPred |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | rfPred_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | rfPred_1.4.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | rfPred_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | rfPred_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/rfPred/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rfPred/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |