要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("rfPred")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

rfPred

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rfPred

将rfPred函数预测分数分配给一个误义变量列表

Bioconductor版本:3.0

基于外部大量的数据文件,其中rfPred评分预先计算了人类外显子组的所有基因组位置,包给出了由染色体、位置(hg19版本)、参考核苷酸和替代核苷酸以及蛋白质的uniprot标识符识别的错义变体的rfPred评分。注意,要使用这个包,用户必须连接到Internet或下载TabixFile和索引(大约3.3 Go)。

作者:Fabienne Jabot-Hanin, Hugo Varet和Jean-Philippe Jais

维护者:Hugo Varet

引用(从R中,输入引用(“rfPred”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("rfPred")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“rfPred”)

PDF R脚本 CalculatingrfPredscoreswithpackagerfPred
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释分类软件
版本 1.4.0
在Bioconductor公司 BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 GPL (>=2)
取决于 RsamtoolsGenomicRangesIRangesdata.table方法,并行
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://www.sbim.fr/rfPred
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 rfPred_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 rfPred_1.4.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) rfPred_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) rfPred_1.4.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/rfPred/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rfPred/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心