要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rTRM”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见rTRM.
Bioconductor版本:3.0
rTRM识别蛋白质-蛋白质相互作用网络中的转录调节模块(TRMs)。
作者:Diego Diez
维护者:Diego Diez
引文(从R内,输入引用(“rTRM”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“rTRM”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“rTRM”)
R脚本 | rTRM介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneRegulation,GraphAndNetwork,网络,软件,转录 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.10),igraph(> = 0.7),RSQLite |
进口 | AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,MotifDb,图,PWMEnrich,biomaRt,knitr,Biostrings,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm8.masked,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,ggplot2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | rTRMui |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | rTRM_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | rTRM_1.4.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | rTRM_1.4.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | rTRM_1.4.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/rTRM/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rTRM/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |