# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rGADEM”)

这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rGADEM。

新创主题发现

Bioconductor版本:3.0

rGADEM是一种有效的新创主题发现大规模基因组序列数据的工具。它是一个开源R包,它是基于GADEM软件。

作者:Arnaud所有权,拉斐尔Gottardo戈登·罗伯逊和莱普

维护人员:Arnaud所有权< Arnaud。所有权在crchuq.ulaval.ca >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rGADEM”)

文档

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browseVignettes (“rGADEM”)

PDF	R脚本	rGADEM用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,ChIPchip,微阵列,MotifDiscovery,测序,软件
版本	2.14.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.11.0),Biostrings,IRanges,BSgenome、方法、seqLogo
进口	Biostrings,IRanges、方法、图形seqLogo
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	MotIV
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	rGADEM_2.14.0.tar.gz
Windows二进制	rGADEM_2.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	rGADEM_2.14.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	rGADEM_2.14.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/rgadem/tree/release - 3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rGADEM/
包下载报告	下载数据