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Qusage
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅Qusage。
Qusage：基因表达的定量集分析
生物导体版本：3.0
该软件包是对基因表达（Qusage）方法的定量集分析（Yaari G.等，Nucl Acids Res，2013）。这是一种新型的基因集富集型测试，旨在提供更快，更准确且易于理解的基因表达研究测试。Qusage使用Wu等人提出的方差通胀因子技术说明了基因之间的相关性。（核酸Res，2012年）。另外，Qusage不简单地评估单个数字（p值）的零假设的偏差，而是用完整的概率密度函数（PDF）量化了基因集活性。从该PDF中，可以轻松提取P值和置信区间。保留PDF还允许事后分析（例如，基因集活性的成对比较），同时保持统计周期性。最后，尽管Qusage与现有方法（例如Limma）的单个基因统计兼容，但实施了一种基于Welch的方法，该方法被证明可以提高特异性。如有疑问，请联系Chris Bolen（cbolen1@gmail.com）或Steven Kleinstein（Steven.kleinstein@yale.edu）
作者：克里斯托弗·博伦（Christopher Bolen）和古尔·Yaari（Gur Yaari），来自Juilee Thakar和Steven Kleinstein的贡献
维护者：gmail.com>的Christopher Bolen
引用（从r内，输入引用（“ Qusage”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Qusage”）
| R脚本 | 运行Qusage | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 基因烯，，，，微阵列，，，，rnaseq，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.13（R-3.0）（2。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.10），林玛（> = 3.14），方法 |
| 进口 | utils，生物酶 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://clip.med.yale.edu/qusage |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | qusage_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | qusage_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | qusage_1.6.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | qusage_1.6.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/qusage/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/qusage/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
