要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qpgraph”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

qpgraph

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见qpgraph

从高通量基因组数据估计遗传和分子调控网络

Bioconductor版本:3.0

从高通量表达和基因分型分析估计基因和eQTL网络的程序。

作者:R. Castelo和A. Roverato

维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>

引文(从R内,输入引用(“qpgraph”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qpgraph”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“qpgraph”)

PDF BasicUsersGuide.pdf
PDF R脚本 使用qpgraph估计eQTL网络
PDF R脚本 利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程
PDF R脚本 利用qpgraph模拟分子调控网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneRegulationGeneticVariability遗传学GraphAndNetwork微阵列NetworkInference通路单核苷酸多态性软件转录
版本 2.0.5
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.0.0)
进口 方法、并行矩阵(>= 1.0),网格,注释(> = 1.44.0),BiobaseS4VectorsBiocParallelAnnotationDbiIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesGenomicFeaturesmvtnormqtlRgraphviz
链接
建议 RUnitBiocGenericsBiocStylegenefilterorg.EcK12.eg.dbrlecuyer类别GOstats
SystemRequirements
增强了
URL http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph
全靠我
进口我 限幅器
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 qpgraph_2.0.5.tar.gz
Windows二进制 qpgraph_2.0.5.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) qpgraph_2.0.5.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) qpgraph_2.0.5.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/qpgraph/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心