要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qpgraph”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见qpgraph.
Bioconductor版本:3.0
从高通量表达和基因分型分析估计基因和eQTL网络的程序。
作者:R. Castelo和A. Roverato
维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>
引文(从R内,输入引用(“qpgraph”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qpgraph”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“qpgraph”)
BasicUsersGuide.pdf | ||
R脚本 | 使用qpgraph估计eQTL网络 | |
R脚本 | 利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程 | |
R脚本 | 利用qpgraph模拟分子调控网络 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GeneRegulation,GeneticVariability,遗传学,GraphAndNetwork,微阵列,NetworkInference,通路,单核苷酸多态性,软件,转录 |
版本 | 2.0.5 |
在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(7年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 3.0.0) |
进口 | 方法、并行矩阵(>= 1.0),网格,注释,图(> = 1.44.0),Biobase,S4Vectors,BiocParallel,AnnotationDbi,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,GenomicFeatures,mvtnorm,qtl,Rgraphviz |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,genefilter,org.EcK12.eg.db,rlecuyer,雪,类别,GOstats |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph |
全靠我 | |
进口我 | 限幅器 |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | qpgraph_2.0.5.tar.gz |
Windows二进制 | qpgraph_2.0.5.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | qpgraph_2.0.5.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | qpgraph_2.0.5.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/qpgraph/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |