要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qcmetrics”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见qcmetrics.
Bioconductor版本:3.0
该软件包为数据的一般质量控制提供了一个框架。它允许创建、管理和可视化单个或组质量控制指标,并生成各种格式的质量控制报告。
作者:Laurent Gatto
维护者:Laurent Gatto
引文(从R内,输入引用(“qcmetrics”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qcmetrics”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“qcmetrics”)
R脚本 | 用于质量控制和报告的“qcmetrics”基础设施 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,MassSpectrometry,微阵列,蛋白质组学,质量控制,ReportWriting,软件,可视化 |
版本 | 1.4.1 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10) |
进口 | Biobase、方法、knitr、工具、喷嘴。R1,xtable,老鸨,S4Vectors |
链接 | |
建议 | affy,MSnbase,ggplot2,晶格,yaqcaffy,MAQCsubsetAFX,RforProteomics,AnnotationDbi,mzR,hgu133plus2cdf |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lgatto/qcmetrics |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | qcmetrics_1.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | qcmetrics_1.4.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | qcmetrics_1.4.1.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | qcmetrics_1.4.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/qcmetrics/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qcmetrics/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |