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门索
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该软件包适用于生物导体的3.0版；对于稳定的最新版本，请参阅门索。
高通量微生物组普查数据的处理和分析。
生物导体版本：3.0
ThyloSeq提供了一组类和工具，以促进微生物组普查数据的导入，存储，分析和图形显示。
作者：Paul J. McMurdie
维护者：Paul J. McMurdie
引用（从r内，输入引用（“ Thyloseq”））：
安装
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文档
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Browsevignettes（“ Thyloseq”）
| html | R脚本 | Thyloseq分析小插图 |
| html | R脚本 | Thyloseq和Deseq2关于结直肠癌数据 |
| html | R脚本 | Thyloseq基础知识 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，聚类，，，，遗传因素，，，，宏基因组学，，，，微生物组，，，，多重组合，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.10（R-2.15）（4年） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.1.0） |
| 进口 | ADE4（> = 1.6.2），猿（> = 3.1.1），Biom（> = 0.3.9），生物弦（> = 2.28.0），簇（> = 1.14.4），Data.Table（> = 1.9.2），deseq2（> = 1.4.0），foreach（> = 1.4.2），GGPLOT2（> = 1.0.0），Igraph（> = 0.7.0），方法（> = 3.1.0），多检验（> = 2.16.0），plyr（> = 1.8），RESHAPE2（> = 1.2.2），秤（> = 0.2.3），素食主义者（> = 2.0.10） |
| 链接 | |
| 建议 | GeneFilter（> = 1.42.0），测试（> = 0.8），尼特（> = 1.3） |
| 系统要求 | |
| 增强 | 多帕尔（> = 1.0.1） |
| URL | http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0061217 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | thyloseq_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Thyloseq_1.10.0.zip |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | Thyloseq_1.10.0.tgz |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | Thyloseq_1.10.0.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/phyloseq/tree/release-3.0 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/phyloseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
