要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ opossom”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

负鼠

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅负鼠

跨越图数据的全面分析

生物导体版本:3.0

该软件包将微阵列表达数据转换为降低尺寸的元数据。它提供了各种以样品为中心和以群体为中心的可视化,样本相似性分析和功能富集分析。基础SOM算法结合了聚类,多维缩放和降低尺寸以及强大的可视化功能。它可以提取和描述数据中固有的功能表达模块。

作者:henry wirth 和Martin Kalcher

维护者:henry wirth

引用(从r内,输入引用(“负鼠”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“负鼠”)

PDF R脚本 负示例
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,软件,,,,可视化
版本 1.1.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.0)
进口 SOM,,,,Fastica,,,,STACTPLOT3D,,,,pixmap,,,,fdrtool,,,,,,,,Igraph,,,,克恩斯门茶, 平行,Biomart,,,,生物酶
链接
建议
系统要求
增强
URL http://som.izbi.uni-leipzig.de
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Opossom_1.1.1.1.tar.gz
Windows二进制 Opossom_1.1.1.1.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) Opossom_1.1.1.1.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) Opossom_1.1.1.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/opossom/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/opossom/
软件包下载报告 下载统计

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