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这个包是3.0版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mzR。

解析器netCDF、mzXML mzData和mzML mzIdentML文件(质谱数据)

Bioconductor版本:3.0

mzR提供了一个统一的API可用的常见的文件格式和解析器质谱数据。它有一个包装器为印度商学院随机访问解析器质谱mzXML, mzData和mzML文件。包包含原始代码写的印度商学院,和mzML proteowizard库的一个子集,mzIdentML。这个曾被用于XCMS netCDF阅读代码。

作者:贝恩德•菲舍尔,史蒂芬诺伊曼。劳伦与,羌族口

维护人员:<贝恩德•贝恩德•费舍尔。费舍尔在embl.de >,史蒂芬诺伊曼在ipb-halle.de > < sneumann。劳伦与< lg390 cam.ac。英国>,羌族口< qkou umail.iu.edu >

安装

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文档

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browseVignettes (“mzR”)

PDF	R脚本	Accessin原始质谱分析和识别数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,MassSpectrometry,代谢组学,蛋白质组学,软件
版本	2.0.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Rcpp(> = 0.10.1)方法,跑龙套
进口	Biobase
链接	Rcpp
建议	msdata,RUnit,faahKO,mzID,BiocStyle,knitr,BiocGenerics
SystemRequirements	GNU, NetCDF zlib
增强了
URL	https://github.com/sneumann/mzR/
取决于我	MSGFgui,MSnbase,TargetSearch,xcms
进口我	MSnID,Pbase,RMassBank
建议我	qcmetrics,RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	mzR_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	mzR_2.0.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	mzR_2.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛)	mzR_2.0.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/mzr/tree/release - 3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mzR/
包下载报告	下载数据