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此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅单片。
Biocometiond版本:3.0
单片机对单细胞表达实验进行差异表达和时间序列分析。它根据生物过程命令单个细胞通过生物学过程,而不是提前知道基因通过该过程定义进展的时间。Monocle还在单个小区表达式数据上执行差异表达分析,群集,可视化和其他有用的任务。它旨在使用RNA-SEQ和QPCR数据,但也可以与其他类型一起使用。
作者:COLE TRAPNELL
维护者:COLE TRAPNELL
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BROWSEVIGNETTES(“单片”)
PDF. | r script. | 单孔:单细胞RNA-SEQ和QPCR实验的差异表达和时间序列分析。 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 自述 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 聚类那DataImport.那datarepresentation.那不同的亚兴那基因表达那基础设施那多匹匹莫森那QualityControl.那rnaseq.那测序那软件那可视化 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.0(R-3.1)(1.5年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.7.0),hsmmsinglecell.那BioBase.那ggplot2.(> = 0.9.3.1),样条,vgam.(> = 0.9-4),iGraph.(> = 0.7.0),普利尔 |
进口 | 生物根系那簇那COMBINAT.那快餐, 网格,IRLBA.那MatrixStats.,方法,平行,重塑2.,统计数据,utils,林马 |
链接到 | |
建议 | kn那HMISC. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | monocle_1.0.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | monocle_1.0.0.zip. |
Mac OS x 10.6(雪豹) | monocle_1.0.0.tgz. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | monocle_1.0.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/monocle/tree/release-3.0 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/monocle/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |