要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“minfi”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

minfi

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见minfi

分析Illumina公司的450k甲基化阵列

Bioconductor版本:3.0

用于分析和可视化Illumina的45万阵列数据的工具

作者:Kasper Daniel Hansen [cre, aut], Martin Ayree [aut], Rafael A. Irizarry [aut], Andrew E. Jaffe [ctb], Jovana Maksimovic [ctb], E. Andres Houseman [ctb], Jean-Philippe Fortin [ctb], Tim Triche [ctb]

维护者:Kasper Daniel Hansen

引文(从R内,输入引用(“minfi”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“minfi”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“minfi”)

PDF R脚本 Minfi指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylationDataImport微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),晶格GenomicRangesBiostrings跑龙套,bumphunter(> = 1.1.9)
进口 S4VectorsIRangesbeanplotRColorBrewernor1mixsiggeneslimmapreprocessCoreilluminaiomatrixStatsmclustgenefilternlme重塑质量quadprog
链接
建议 IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19minfiData(> = 0.4.1),FlowSorted.Blood.450k(> = 1.0.1),RUnit消化
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/kasperdanielhansen/minfi
全靠我 冠军CopyNumber450kCopyNumber450kDataDMRcateFlowSorted.Blood.450kFlowSorted.DLPFC.450kIlluminaHumanMethylation27kmanifestIlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19IlluminaHumanMethylation450kmanifestmethylumiminfiDatashinyMethyl
进口我 MethylAidmethylumimissMethylquantro
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 minfi_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 minfi_1.12.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) minfi_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) minfi_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/minfi/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/minfi/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心