要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“甲基pipe”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

甲基管

该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅甲基管

基础分辨率DNA甲基化数据分析

生物导体版本:3.0

CPG和非CPG序列上下文中基础分辨率DNA甲基化数据的记忆有效分析。从提供基础或低分辨率数据的任何方法中得出的DNA甲基化数据的整合。

作者:Kamal Kishore

维护者:kamal kishore

引用(从r内,输入引用(“甲基管”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“甲基pipe”)

文档

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Browsevignettes(“甲基管”)

PDF R脚本 甲基植物.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,甲基,,,,测序,,,,软件
版本 1.0.5
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(1。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.1.1),方法,Grdevices,Graphics,Stats,Utils,基因组机,,,,rsamtools
进口 Marray,,,,GPLOTS,,,,iranges,,,,生物基因,,,,GVIZ,,,,基因组签名,,,,生物弦, 平行,Data.Table,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg18.nown,,,,尼特,,,,甲基赛克
系统要求
增强
URL
取决于我 Listeretalbsseq
进口我 Compepitools
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 甲基Pipe_1.0.5.5.tar.gz
Windows二进制 甲基Pipe_1.0.5.5.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) 甲基Pipe_1.0.5.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) 甲基Pipe_1.0.5.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/methylpipe/tree/release-3.0
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methylpipe/
软件包下载报告 下载统计

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