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##尝试http://如果不支持https:// urls源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“methyAnalysis”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅甲烷分析。
Biocometiond版本:3.0
甲基甲基分析包旨在DNA甲基化数据分析和可视化。定义新类以将染色体位置信息与数据一起保持在一起。当前版本的包装主要专注于分析Illumina Infinium甲基化阵列数据,但大多数方法都可以推广到其他甲基化阵列或测序数据。
作者:潘杜,理查德布尔冈
维护者:Pan du
引文(从R内,输入引文(“methyAnalysis”)
):
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BROWSEVIGNETTES(“甲基甲基分析”)
PDF. | r script. | 甲基半分析包的介绍 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 德甲基化那微阵列那软件那可视化 |
版本 | 1.8.0. |
在生物导体中以来 | BIOC 2.11(R-2.15)(3.5岁) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 2.10),网格,生物根系那S4Vectors.那绞喉那genomeinfodb.那Genomicranges.那BioBase.(> = 2.5.5),org.hs.eg.db. |
进口 | lumi.那弥撒那GVIZ.那Genoset.那Genomicranges.那绞喉那rtracklayer.那基因组法那注释那BioBase.(> = 2.5.5),annotationdbi.那Genefilter.那生物雕,并行方法 |
链接到 | |
建议 | Fdb.infiniummethylation.hg19.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 弥撒 |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | methyanalysis_1.8.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | methyanalysis_1.8.0.zip. |
Mac OS x 10.6(雪豹) | methyanalysis_1.8.0.tgz. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | methyanalysis_1.8.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocondudard-mirror/methyanysis/tree/release-3.0 |
包短网址 | http://biocumon.org/packages/methyanysis/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |