要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见macat.
Bioconductor版本:3.0
这个文库包含功能,以调查差异基因表达和基因的染色体定位之间的联系。MACAT的动机是对肿瘤细胞中涉及大染色体区域的常见现象的观察。MACAT是用于识别显著差异表达的染色体区域的统计方法的实施。这些函数已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试,该数据集在“stjudem”库中提供。
作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling
维护者:Joern Toedling
引文(从R内,输入引用(“macat”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“macat”)
R脚本 | 微阵列染色体分析工具 | |
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.40.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,注释 |
进口 | |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db,stjudem |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | macat_1.40.0.tar.gz |
Windows二进制 | macat_1.40.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | macat_1.40.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | macat_1.40.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/macat/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |