要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

macat

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见macat

微阵列染色体分析工具

Bioconductor版本:3.0

这个文库包含功能,以调查差异基因表达和基因的染色体定位之间的联系。MACAT的动机是对肿瘤细胞中涉及大染色体区域的常见现象的观察。MACAT是用于识别显著差异表达的染色体区域的统计方法的实施。这些函数已经在一个关于急性淋巴细胞白血病(Yeoh et al.Cancer Cell 2002)的公开数据集上进行了测试,该数据集在“stjudem”库中提供。

作者:Benjamin Georgi, Matthias Heinig, Stefan Roepcke, Sebastian Schmeier, Joern Toedling

维护者:Joern Toedling

引文(从R内,输入引用(“macat”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“macat”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“macat”)

PDF R脚本 微阵列染色体分析工具
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpression微阵列软件可视化
版本 1.40.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase注释
进口
链接
建议 hgu95av2.dbstjudem
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 macat_1.40.0.tar.gz
Windows二进制 macat_1.40.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) macat_1.40.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) macat_1.40.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/macat/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/macat/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心