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此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本，请参阅lumi.。

illumina甲基化和表达微阵列的Beadarray特定方法

Biocometiond版本：3.0

LUMI封装为Illumina微阵列数据分析提供了一个集成的解决方案。它包括Illumina Beadstudio（GenomeStudio）数据输入，质量控制，比尔阵列特异性方差稳定，校准和基因注释的功能。它还包括处理Illumina甲基化微阵列的功能，特别是Illumina Infin甲基化微阵列。

作者：潘杜，理查德布尔冈，刚峰，西蒙林

维护者：Pan du

安装

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文件

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BROWSEVIGNETTES（“LUMI”）

PDF.	r script.	分析Illumina Infinium甲基化微阵列数据
PDF.	r script.	Lumi包中VST算法评估
PDF.	r script.	通过nuiD解决Illumina标识符的不一致
PDF.	r script.	使用Lumi包装加工Illumina MicroArray
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	德甲基化那微阵列那oneChannel.那预处理那QualityControl.那软件那两种通道
版本	2.18.0
在生物导体中以来	BIOC 2.0（R-2.5）（9年）
执照	LGPL（> = 2）
依靠	r（> = 2.10），BioBase.（> = 2.5.5）
进口	敬服（> = 1.23.4），弥撒（> = 2.3.2），基因组法那Genomicranges.那注释那BioBase.（> = 2.5.5），格子那mgcv.（> = 1.4-0），nleqslv.那kernsmooth.那预处理核那rsqlite.那DBI.那annotationdbi.那大量的，图形，统计数据，stats4，方法
链接到
建议	Beadarray那林马那VSN.那lumibarnes.那lumihumanall.db.那lumihumanidmappping那Genefilter.那rcolorbrewer.
系统要求
加强
URL.
取决于我	Arraymvout.那ffpeexampledata.那lumibarnes.那lumihumanidmappping那lumimouseidmappping那lumiratidmapping那MAQCSUBSET.那maqcsubsetilm.那mvoutdata.那西瓜
进口我	FFPE.那甲烷分析那雷尼卡
建议我	Beadarray那宝石那弥撒那蒂格雷
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源	lumi_2.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	lumi_2.18.0.zip.
Mac OS x 10.6（雪豹）	lumi_2.18.0.tgz.
Mac OS x 10.9（mavericks）	lumi_2.18.0.tgz.
subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/lumi/tree/release-3.0
包短网址	http://biocidodder.org/packages/lumi/
包裹下载报告	下载统计信息