limma
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此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本，请参见limma。
微阵列数据的线性模型
Bioconductor版本:3.0
微阵列数据的数据分析、线性模型和差异表达。
作者:Gordon Smyth, Matthew Ritchie, Jeremy Silver, James Wettenhall, Natalie Thorne, Davis McCarthy, Di Wu, Yifang Hu, Wei Shi, Belinda Phipson, Alicia Oshlack, Carolyn de Graaf, Mette Langaas, Egil Ferkingstad, Marcus Davy, Francois Pepin，Dongseok崔(施)
维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>
安装
要安装这个软件包，请从R开始，然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“limma”)
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“limma”)
细节
| biocViews |
AlternativeSplicing,BatchEffect,贝叶斯,聚类,DataImport,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ExonArray,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,微阵列,MultipleComparison,归一化,OneChannel,预处理,ProprietaryPlatforms,质量控制,RNASeq,回归,软件,TimeCourse,转录,TwoChannel,mRNAMicroarray,microRNAArray |
| 版本 |
3.22.7 |
| Bioconductor自 |
BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
| 许可证 |
GPL (> = 2) |
| 取决于 |
R(>= 2.3.0)，方法 |
| 进口 |
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| 链接 |
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| 建议 |
statmod(> = 1.2.2),样条函数,locfit,质量,椭圆,Biobase,affy,vsn,AnnotationDbi,org.Hs.eg.db,GO.db,illuminaio,BiasedUrn |
| SystemRequirements |
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| 增强了 |
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| URL |
http://bioinf.wehi.edu.au/limma |
| 取决于我 |
a4Base,AffyExpress,AgiMicroRna,吸引,birta,CALIB,亚兰,cghMCR,ChimpHumanBrainData,clippda,codelink,转换,COPDSexualDimorphism,Cormotif,coRNAi,DiffBind,DMRcate,DrugVsDisease,刨边机,ExiMiR,有限元法,Fletcher2013a,gCMAP,HD2013SGI,HTqPCR,limmaGUI,maigesPack,maPredictDSC,marray,metagenomeSeq,metaseqR,MLSeq,MmPalateMiRNA,nem,PADOG,prot2D,qpcrNorm,qusage,林格,Rnits,snapCGH,SSPA,tRanslatome,TurboNorm,西瓜 |
| 进口我 |
affycoretools,affylmGUI,ArrayExpress,arrayQuality,arrayQualityMetrics,ArrayTools,吸引,舞会礼服,beadarray,BeadArrayUseCases,betr,bumphunter,CALIB,CancerMutationAnalysis,卡斯珀,冠军,魅力,ChIPpeakAnno,compcodeR,csaw,EnrichmentBrowser,erccdashboard,explorase,flowBin,GeneSelectMMD,GeneSelector,GGBase,GOsummaries,HTqPCR,iChip,lmdme,LVSmiRNA,maSigPro,minfi,missMethyl,MmPalateMiRNA,单片眼镜,MSstats,奥林,PAA,PADOG,PECA,pepStat,phenoTest,PhenStat,ReportingTools,林格,RNAinteract,RNAither,研制,RTopper,SimBindProfiles,snapCGH,systemPipeR,timecourse,ToPASeq,tweeDEseq,vsn |
| 建议我 |
ABarray,ADaCGH2,beadarraySNP,BiocCaseStudies,生命网络,类别,categoryCompare,ClassifyR,CMA,coGPS,dyebias,肘,计,GeneSelector,GEOquery,GSRI,GSVA,Heatplus,inSilicoDb,等压线,莱斯,光民,mammaPrintData,methylumi,中长期规划,npGSEA,益生元,oneChannelGUI,paxtoolsr,PGSEA,钢琴,plw,PREDA,彪马,Rcade,RTopper,rtracklayer,seventyGeneData,股东价值分析 |
| 构建报告 |
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包档案
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