要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“isobar”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

等压线

此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见等压线

等压标记的MSMS蛋白质组学数据的分析和定量

Bioconductor版本:3.0

isobar为用iTRAQ和TMT等压标记的定量质谱蛋白质组学数据的分析提供了预处理、归一化和生成报告的方法。功能模块用于集成和验证以ptm为中心的数据集(isobar-PTM)。更多信息请访问http://www.ms-isobar.org。

作者:Florian P Breitwieser ,由Xavier Robin < Xavier贡献。罗宾在unige。ch>和Florent Gluck < Florent . ch>和Florent。格拉克在unige.ch>

维护者:Florian P Breitwieser

引文(从R内,输入引用(“等压线”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“isobar”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“等压线”)

PDF R脚本 开发人员的等压线bob电竞体育官网
PDF R脚本 用于PTM数据集量化的等压线
PDF R脚本 iTRAQ和TMT蛋白定量等压包
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学MassSpectrometryMultipleComparisons蛋白质组学质量控制软件
版本 1.12.2
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 LGPL-2
取决于 R (>= 2.10.0),Biobase,统计,方法,plyr
进口 分配
链接
建议 MSnbaseOrgMassSpecRXMLbiomaRtggplot2RJSONIOHmiscgplotsRColorBrewergridExtralimma引导分配DBI质量
SystemRequirements
增强了
URL http://www.ms-isobar.org
全靠我
进口我
建议我 RforProteomics
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 isobar_1.12.2.tar.gz
Windows二进制 isobar_1.12.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) isobar_1.12.2.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) isobar_1.12.2.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/isobar/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/isobar/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心