要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“isobar”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见等压线.
Bioconductor版本:3.0
isobar为用iTRAQ和TMT等压标记的定量质谱蛋白质组学数据的分析提供了预处理、归一化和生成报告的方法。功能模块用于集成和验证以ptm为中心的数据集(isobar-PTM)。更多信息请访问http://www.ms-isobar.org。
作者:Florian P Breitwieser
维护者:Florian P Breitwieser
引文(从R内,输入引用(“等压线”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“isobar”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“等压线”)
R脚本 | 开发人员的等压线bob电竞体育官网 | |
R脚本 | 用于PTM数据集量化的等压线 | |
R脚本 | iTRAQ和TMT蛋白定量等压包 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | 生物信息学,MassSpectrometry,MultipleComparisons,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.12.2 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | LGPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10.0),Biobase,统计,方法,plyr |
进口 | 分配 |
链接 | |
建议 | MSnbase,OrgMassSpecR,XML,biomaRt,ggplot2,RJSONIO,Hmisc,gplots,RColorBrewer,gridExtra,limma,引导,分配,DBI,质量 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.ms-isobar.org |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | RforProteomics |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | isobar_1.12.2.tar.gz |
Windows二进制 | isobar_1.12.2.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | isobar_1.12.2.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | isobar_1.12.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/isobar/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/isobar/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |