要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("iChip")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
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此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见iChip.
Bioconductor版本:3.0
该软件包使用隐藏的Ising模型来识别ChIP-chip数据中的富集基因组区域。它可以用于分析来自多个平台(如Affymetrix、Agilent和NimbleGen)的数据,以及具有单个到多个副本的数据。
作者:莫谦兴
维护者:Qianxing Mo
引用(从R中,输入引用(“iChip”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("iChip")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“iChip”)
R脚本 | iChip | |
参考手册 |
biocViews | AgilentChip,ChIPchip,微阵列,OneChannel,软件 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R (>= 2.10.0) |
进口 | limma |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | iChip_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | iChip_1.20.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | iChip_1.20.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | iChip_1.20.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/iChip/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/iChip/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |