要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("iChip")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

iChip

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见iChip

基于隐Ising模型的芯片数据贝叶斯建模

Bioconductor版本:3.0

该软件包使用隐藏的Ising模型来识别ChIP-chip数据中的富集基因组区域。它可以用于分析来自多个平台(如Affymetrix、Agilent和NimbleGen)的数据,以及具有单个到多个副本的数据。

作者:莫谦兴

维护者:Qianxing Mo

引用(从R中,输入引用(“iChip”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("iChip")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“iChip”)

PDF R脚本 iChip
PDF 参考手册

细节

biocViews AgilentChipChIPchip微阵列OneChannel软件
版本 1.20.0
在Bioconductor公司 BioC 2.6 (R-2.11)(6年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.10.0)
进口 limma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 iChip_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 iChip_1.20.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) iChip_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) iChip_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/iChip/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/iChip/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心