要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“htseqtools”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

htseqtools.

此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅htseqtools.

高吞吐量测序数据的质量控制,可视化和处理

Biocometiond版本:3.0

我们为高吞吐量排序(芯片-SEQ,RNAseq等)提供高效,易于使用的工具。这些包括MDS图(类似于PCA),检测低效免疫沉淀或过扩增伪影,用于识别和测试具有大累积读取的基因组区域的工具,以及覆盖概况的可视化。

作者:救护主义行星,Camille Stephan-Otto,Oscar Reina,Oscar Flores,David Rossell

维护者:奥斯卡雷纳<奥斯卡尔。在Irbbarcelona.org>

引文(从R内,输入引文(“htseqtools”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“htseqtools”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“htseqtools”)

PDF. r script. htseqtools库手册
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. QualityControl.测序软件
版本 1.12.0
在生物导体中以来 BIOC 2.9(R-2.14)(4.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 R(> = 2.12.2),方法,生物根系(> = 0.1.0),BioBase.绞喉, 方法,大量的bsgenome.genomeinfodb.(> = 1.1.3),Genomicranges.(> = 1.17.11)
进口
链接到
建议
系统要求
加强 多夜
URL.
取决于我
进口我
建议我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包来源 htseqtools_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件 htseqtools_1.12.0.zip.
Mac OS x 10.6(雪豹) htseqtools_1.12.0.tgz.
Mac OS x 10.9(mavericks) htseqtools_1.12.0.tgz.
subversion源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/biocumon-mirror/htseqtools/tree/release-3.0
包短网址 http://biocidodder.org/packages/htseqtools/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网
Fred Hutchinson癌症研究中心