要安装此包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“htseqtools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本,请参阅htseqtools.。
Biocometiond版本:3.0
我们为高吞吐量排序(芯片-SEQ,RNAseq等)提供高效,易于使用的工具。这些包括MDS图(类似于PCA),检测低效免疫沉淀或过扩增伪影,用于识别和测试具有大累积读取的基因组区域的工具,以及覆盖概况的可视化。
作者:救护主义行星,Camille Stephan-Otto,Oscar Reina,Oscar Flores,David Rossell
维护者:奥斯卡雷纳<奥斯卡尔。在Irbbarcelona.org>
引文(从R内,输入引文(“htseqtools”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“htseqtools”)
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“htseqtools”)
PDF. | r script. | htseqtools库手册 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | QualityControl.那测序那软件 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.9(R-2.14)(4.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 2.12.2),方法,生物根系(> = 0.1.0),BioBase.那绞喉, 方法,大量的那bsgenome.那genomeinfodb.(> = 1.1.3),Genomicranges.(> = 1.17.11) |
进口 | |
链接到 | |
建议 | |
系统要求 | |
加强 | 多夜 |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
包来源 | htseqtools_1.12.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | htseqtools_1.12.0.zip. |
Mac OS x 10.6(雪豹) | htseqtools_1.12.0.tgz. |
Mac OS x 10.9(mavericks) | htseqtools_1.12.0.tgz. |
subversion源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/biocumon-mirror/htseqtools/tree/release-3.0 |
包短网址 | http://biocidodder.org/packages/htseqtools/ |
包裹下载报告 | 下载统计信息 |