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此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本，请参见hopach．

分层有序分区和折叠混合(HOPACH)

Bioconductor版本:3.0

HOPACH聚类算法通过递归地划分数据集来构建一个簇的层次树，同时在每个级别上对簇进行排序和可能的折叠。该算法使用均值/中值分割轮廓(MSS)准则来识别具有最大同质聚类的树的级别。它还向下运行树以生成元素的最终有序列表。非参数引导允许人们估计每个元素属于每个聚类(模糊聚类)的概率。

作者:Katherine S. Pollard, Mark J. van der Laan < Laan at stat.berkeley.edu>和Greg Wall

维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard在gladstone.ucsf.edu>

安装

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文档

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PDF	R脚本	hopach
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类，软件
版本	2.26.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.11.0)，集群，Biobase、方法
进口	图形，grDevices，统计，utils，BiocGenerics
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.stat.berkeley.edu/~laan/http://docpollard.org/
全靠我
进口我	phenoTest
建议我	BiocCaseStudies
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	hopach_2.26.0.tar.gz
Windows二进制	hopach_2.26.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	hopach_2.26.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	hopach_2.26.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/hopach/tree/release-3.0
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/hopach/
软件包下载报告	下载数据